يستعرضّ الجزءُ الثاني من الموسوعة الفقهيّة مراحلَ نشوء المذاهب الإسلاميّة وتطوّرها التاريخيّ وصولًا إلى نهايات القرن الثالث الهجريّ. يُبرز الكتابُ جهودَ الإمامين الباقر والصادق العظيمة في حفظ الشريعة المحمّدية وإرساء القواعد العلميّة. يتناول الباحثُ ظهورَ المذاهب السبعة واستقلالها المنهجيّ فضلًا عن دراسة المذاهب المنقرضة وتراجم أبرز رموزها الفقهيّة. تختتم الدراسةُ مستلهمةً رؤيةَ أمير المؤمنين العميقة مُحذِّرةً من اتّباع الأهواء ومؤكّدةً حتميّةَ انتصار الحقِّ الناصع مهما طالت الأيامُ وتعدّدت الآراءُ الفرديّة.